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doxygenを使う。

インストール
楽天が運営するポータルサイト : 【インフォシーク】Infoseek
とかでgraphvizを使える用にしとく。
とりあえず日本語を使える用にする
doxygenの文字化け対策 - 僻地のプログラマkmt-t - わりとどうでもいい日記 1.1
上のページがwindowsなら無難。
とりあえずコメントの書き方

後しいていうなら
TODOリストを作りたければ

//! @todo TODOコメント

bugリストを作りたければ

//! @bug bugコメント

とりあえずこのくらいを使う。